Классификация вирусов

Классификация и номенклатура вирусов – раздел вирусологии подвергающийся постоянному усовершенствованию и улучшению. Данные понятия продолжительное время формировались исходя их представления ученых о природе вирусов^[1]. Современная классификация вирусов отчасти основана на предложении Дэйвида Балтимора о разделении вирусов на 7 групп на основе типа геномной нуклеиновой кислоты и способе ее репликации^[4].

Состояние вопроса

На сегодняшний день нет общей, единой и общепризнанной классификации вирусов. Создание ее затруднено по многим причинам. Достаточно уже того, что применение самого понятия «вид» к вирусам во многом является спорным, поскольку вирусы не являются обычными биологическими объектами, а некоторым образом расположены на границе живого и неживого^[1].

Некоторые системы классификации вирусов

Попытки классифицировать их предпринимались за долго до получения данных по морфологии, структуре и биохимического состава вирусов^[2].

Одна из первых предложена в 1927 году Д. Джонсоном. При обозначении вирусов указывалось название растения-хозяина, добавляя слово «вирус» и порядковый номер обнаружения вируса на конкретном растении. При такой классификации вирус табачной мозаики, получил название табачный вирус 1. Следующий вирус, обнаруженный на табаке, получил название табачный вирус 2. При таком подходе в одну группу попадали абсолютные разные вирусы^[1].

Одновременно предлагалось классифицировать вирусы по насекомым переносчикам. Но есть вирусы, переносимые многими переносчиками, а так же различные вирусы, переносимые одним и тем же переносчиков. Кроме того, существуют вирусы не имеющие переносчиков^[1].

Классификация вирусов по симптомам болезней так же не явилась определяющей, поскольку существует множество болезней со сходными симптомами^[1].

В 1935 году Стенли получил вирус в кристаллическом виде. Тут же было выдвинута идея систематизировать вирусы по их способности к кристаллизации (Кристаллобиотэ и Плазмобиотэ)^[1].

В 1937 К. Смит предложил видоизменить систему Д. Джонсона. Вирус обозначался родовым названием растения с добавлением к нему слова «вирус» и соответствующей цифру, а для штамма еще и буквы. В данной системе вирус табачной мозаики получил наименование Nicotianavirus1^[1].

Ф. Холмс (1939,1948) предложил биноминарную номенклатуру вирусов и обосновал принцип единой классификации всех вирусов. Он объединил вирусы в порядок Virales с тремя подпорядками: Phgineae (бактериофаги), Phytophagineae (вирусы растений), Zoophagineae (вирусы животных). Однако и данная классификация не учитывает все возможные свойства вирусов^[1].

В 1966 году А.Е. Проценко предложил классифицировать фитопатогенные вирусы на основании строения и свойствах вирусных частиц (вирионов). По мере накопления сведений о вирусах, классификация на основании характеристики вирионов стала представляться самой объективной^[1].

В 1971 году Б.Д. Харрисон предложил использовать для классификации вирусов около 50 признаков. На основании их сравнительного анализа фитовирусы были объединены в 26 групп^[1].

В 1966 году на Международном микробиологическом конгрессе в Москве был создан Международный Комитет по номенклатуре вирусов. Это позволило значительно упорядочить классификацию и номенклатуру вирусов. В 1973 году этот комитет получил название Международный Комитет по таксономии вирусов – МКТВ (International CommitteeonTaxonomyof Viruses– ICTV). Данный комитет готовит и публикует доклады по усовершенствованной на данное время таксономии и номенклатуре вирусов^[2].

В 1971 году американский биохимик, вирусолог, молекулярный биолог, лауреат Нобелевской премии Д. Балтимор предложил классифицировать вирусы на основе типа геномной нуклеиновой кислоты и способе ее репликации. Балтимор разделил вирусы на 7 групп:

• I группа – вирусы с двуцепочечной (дц) ДНК, не имеющие РНК-стадии (герпесвирусы, проксивирусы);
• II группа – вирусы с одноцепочечной (оц) ДНК (парвовирусы);
• III группа – вирусы с двуцепочечной (дц) РНК (ротавирусы);
• IV группа – вирусы с одноцепочечной (оц) плюс-РНК (пикорнавирусы, флавивирусы);
• V группа – вирусы с одноцепочечной (оц) РНК негативной или двойной полярности (ортомиксовирусы, филовирусы);
• VI группа – вирусы с одноцепочечной (оц) плюс-РНК, имеющие в процессе жизненного цикла стадию синтеза ДНК на матрице РНК (ретровирусы);
• VII группа – вирусы с двуцепочечной (дц) ДНК, имеющие в процессе жизненного цикла стадию синтеза ДНК на матрице РНК (вирус гепатита В)^[4].