Синонимы |
|
|
Rhizobiaceae |
Домен |
Прокариоты - Procaryota |
Царство |
Бактерии - Eubacteria |
Тип |
Грациликуты - Gracilicutes |
Класс |
Скотобактерии - Scotobacteria |
Порядок |
|
Семейство Ризобиалес (Rhizobiaceae) – таксон филлогенетической классификации. Семейство включено в Альфа–2 подкласс Proteobacteria на основании сравнения последовательностей рибосомальных РНК генов. Основной характеристикой бактерий семейства считается способность вызывать появление новообразований у растений. В настоящее время к семейству относят 7 родов: Rhizobium, Bradyrhizobium, Agrobacterium, Azorhizobium, Phyllobacterrium, Sinorhizobium, Mesorhizobium[1][3]. В фенотипической классификации роды Rhizobium, Bradyrhizobium, Agrobacterium относятся к группе «Грамотрицательные палочки и кокки, обладающие аэробным дыханием». Эти роды включены в тип Грациликуты (Gracilicutes), класс Скотобактерии (Scotobacteria)[5][4][2]. |
Впервые бактерии из клубеньков в чистую культуру выделил М. Бейеринк. Он дал им название – Bacillus radicicola. Таксономия данной группы симбиотов и количество видов были предметом дискуссии в течение 30 лет. Frank назвал клубеньковые бактерии – Rhizobium leguminosarum[3].
К 1929 году было признано существование 6 видов. Для их идентификации использовали способность формировать клубеньки на корнях определенных видов растений семейства Бобовых. Создавались так называемые, группы перекрестной инокуляции. В 1940 году выделение новых видов на основе групп перекрестной инокуляции было прекращено, поскольку были выявлены многочисленные перекрывания данных групп. Систематики стали обращать больше внимания на другие показатели: скорость роста, продукцию кислот, серологию, соотношения оснований ДНК, гибридизацию ДНК, нумерологическую таксономию, чувствительность к фагам. Несмотря на накопленные данные, таксономическая классификация симбиотов бобовых, принятая в 1929 году, формально признавалась и сохранялась в списке признанных видов бактерий до 1980 года[3].
Разделение родов Rhizobium и Bradyrhizobium сомнений не вызывает. Эти рода различаются по многим важным физиологическим и морфологическим свойствам. Симбиоты рода Azorhizobium резко отличаются от Rhizobium и Bradyrhizobium. До недавнего времени в дополнении к этим родам выделяли только роды Agrobacterium и Phyllobacterrium. Вскоре стало очевидным наличие ещё трех генетических групп в пределах рода Rhizobium. Было предложено выделить их в самостоятельные роды[3].
Род Sinorhizobium был выделен на основании данных о гомологии генов рРНК малой субъединицы рибосомы. Было предложено и формально принято и ещё одно родовое название – Mesorhizobium[3].
В настоящее время в семейство Ризобиалес (Rhizobiaceae) включено 7 родов: Rhizobium, Bradyrhizobium, Agrobacterium, Azorhizobium, Phyllobacterrium, Sinorhizobium, Mesorhizobium. Вполне ожидаемо появление новых родов или перенос видов из одного рода в другой[3].
Род Rhizobium – типовой штамм Rhizobium leguminosarum. Выделено четыре вида. Есть предложения о выделении еще трех видов дополнительно. Выделение видов основано на схожести нуклеотидных последовательностей рРНК малой субъединицы рибосомы[3].
Род Bradyrhizobium – идентифицуруют два вида, являющиеся симбиотами сои. Есть предложение о выделении третьего вида. Представители рода выделяются из группы других симбиотов медленным ростом, способностью к подщелачиванию среды и отсутствием зоны свертывания на молоке с лакмусом[3].
Род Agrobacterium – в настоящее время включает 11 видов и 13 геномов видов в составе комплекса Agrobacterium tumefaciens. Состав рода определен главным образом по результатам мультилокусного секвенирования генов домашнего хозяйства или сравнительного анализа полных геномов[1].
Род Azorhizobium – представлен только одним видом – Azorhizobium caulinodans. Бактерии образуют клубеньки на стеблях Sesbania rostrata (растение семейства бобовых). Штаммы, выделенные из этих клубеньков способны к диазотрофному росту на безазотной среде. На основании данных о реассоцации ДНК-ДНК типовой вид может быть разделен на два геномных вида. Однако второй вид не получил до настоящего времени самостоятельного названия в связи с отсутствием четких фенотипических отличий[3].
Род Phyllobacterrium – наименее изученный род семейства Rhizobiaceae. Бактерии рода выявлены на поверхности и в разрастаниях листьев некоторых тропических растений, и из корней сахарного тростника. Штаммы идентифицированы как Phyllobacterrium путем фенотипического анализа и электрофоретического анализа белков. Нуклеотидные последовательности рРНК малой субъединицы рибосомы у двух типовых видов сходны. Однако данные реассоциации ДНК отсутствуют, это затрудняет идентификацию видов. Эти последовательности гомологичны с родом Mesorhizobium. Это говорит о филогенетической близости обоих родов и необходимости доказательства, что род Phyllobacterrium является самостоятельной группой, отдельной от рода Mesorhizobium[3].
Род Sinorhizobium – состоит из четырех признанных видов, быстрорастущих ризобий сои, выделенных в Китае и недавно предложенного вида, вступающего в симбиоз с многолетней и некоторыми однолетними видами люцерны[3].
Род Mesorhizobium – выделено пять видов. Представители характеризуются быстрым ростом и продукцией кислоты. Из-за этого долгое время были включены в род Rhizobium. У двух видов жгутикование полярное или субполярное, что отличает от перетрихиального жгутикования других быстрорастущих ризобий. Бактерии этого рода растут медленнее, чем род Rhizobium, но быстрее чем бактерии рода Bradyrhizobium. По филогенетическим признакам род выделяется локализацией симбиотических генов в хромосоме, а не на плазмидах. Выделение рода подтверждено данными о гомологии ДНК и генов рРНК малой субъединицы рибосомы[3].
Представители родов Rhizobium, Bradyrhizobium, Azorhizobium, Sinorhizobium, Mesorhizobium являются свободно живущими гетеротрофами. Одновременно в их жизненном цикле присутствует стадия симбиотического взаимодействия с бобовыми растениями. Отмечается, что при высеве в почву новой бобовой культуры, специфичные штаммы бактерий-симбиотов немногочисленны и для обеспечения высокого уровня фиксации азота и увеличения урожайности требуется искусственная инокуляция. После нескольких лет выращивания определенной культуры бобовых, доля специфичных видов в почве возрастает без искусственной инокуляции[3].
На развитие ризобий в почве влияют:
Семейство Ризобиалес (Rhizobiaceae) – широко распространено в почвах по всему миру[1].
Бактерии семейства Ризобиалес (Rhizobiaceae), в симбиозе с растениями семейства бобовых, способствуют накоплению в почве биологического азота. Это снижает потребность в азотных удобрениях и улучшает качество почвы. Биологически фиксированный азот связывается с органическим веществом почвы. Это делает его менее доступным для физико-химической трансформации[1][3].
Увеличение биологического азота в почве за счет использования бактерий-симбиотов позволяет успешно реализовывать один из основных направлений устойчивого земледелия – контроль за циркуляцией азотных соединений в экосистемах[1][3].
Семейство Ризобиалес (Rhizobiaceae) – включает ряд фитопатогенных организмов. В частности виды рода Agrobacterium внедряются в растительные ткани двудольных и голосеменных растений и вызывают их трансформацию в опухолевые клетки (опухоль)[4].
Составитель: Григоровская П.И.
Последнее обновление: 08.04.21 15:57
Воронина М.В. Фитопатогенные бактерии рода Agrobacterium: генетическое разнообразие, диагностика, меры защиты Специальность 03.02.03 – микробиология 06.01.07 – защита растений, ФГАОУВО РУНДН, Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук, Москва, 2018 г – 180 с.
Лысак В.В. Микробиология : учеб. пособие / В. В. Лысак. – Минск: БГУ, 2007 – 430 с
Оставьте свой отзыв:
Отзывы:
Комментарии для сайта Cackle