Марганец играет важную роль в окислительно-восстановительных реакциях, протекающих в растении; он входит в состав ферментов, с помощью которых происходят данные процессы.

Марганец участвует в процессах фотосинтеза, дыхания, в углеводном и белковом обмене. Он ускоряет отток углеводов из листьев в корень. Кроме того, марганец участвует в синтезе витамина С и других витаминов, увеличивает содержание сахара в корнеплодах сахарной свеклы, белков в зерновых культурах.

При недостатке данного элемента замедляется развитие корневой системы и рост растений, снижается урожайность.