Криптограмма

Произвольные названия вирусов целесообразно сопровождать криптограммами. Основными разработчиками таких зашифрованных сведений о вирусе считают А. Гибса и В. Харисона.В частности, криптограмма вируса табачной мозаики (ВТМ) имеет вид R/1:2/5:E/E:S/O. Все четыре пары символов криптограммы вируса несут определенную информацию^[1].

Первая пара

Первая пара символов, применительно к вирусу табачной мозаики – это R/1, указывает на тип нуклеиновой кислоты (R– это РНК, D– ДНК) и число нитей в молекуле (1 – однонитевая, 2 – двухнитевая)^[1].

Вторая пара

Вторая пара символов, применительно к вирусу табачной мозаики – это 2/5, обозначает молекулярную массу нуклеиновой кислоты (в миллионах дальтон) и ее содержание в инфекционных единицах (в процентах)^[1].

Запись второй пары символов криптограммы вируса табачной мозаики демонстрирует, что молекулярная масса рибонуклеиновой кислоты (РНК) вириона данного вируса составляет два миллиона дальтон, а содержание нуклеиновой кислоты в вирионе – 2%^[1].

Если вирус имеет фрагментированный геном, то это так же находит отражение в криптограмме. Если разные фрагменты генома входят в состав однородных частиц, то первый символ второй пары символов обозначает общую молекулярную массу всех фрагментов. Примером может служить криптограмма вируса раневых опухолей клевера – R/2:16/22:S/S: S/Au^[2][1].

Расположение фрагментов генома в частицах разного типа описывается отдельно состав частиц каждого типа. Примером служит криптограмма вируса погремковости табака – R/1:23/5 +0,6/5+1,3/5;E/E: S/Ne^[2].

Третья пара

Третья пара символов, применительно к вирусу табачной мозаики – это E/E, характеризует форму вириона и форму капсида^[1].

Для обозначения формы вириона и капсида принято использовать следующие символы:

• S– сферическая или близкая к сферической форма;
• E– удлиненная структура с параллельными сторонами и незакругленными концами;
• U– удлиненная форма с параллельными сторонами и закругленным одним или обоими концами;
• X– сложная или отличная от выше перечисленных форма^{[2] [1]}.

В частности, согласно криптограмме, у вируса табачной мозаики вирион и капсид удлиненной структуры с параллельными сторонами и незакругленными концами (E/E)^[1].

Четвертая пара

Четвертая пара символов, применительно к вирусу табачной мозаики – это S/O. Она обозначает тип заражаемого хозяина и тип переносчика. Для обозначения типа инфицируемого организма (хозяина) применяют следующие символы:

• A – водоросли (alga);
• B – бактерии (bacterium);
• F – грибы (fungus);
• I – беспозвоночные (invertebrate);
• M – микоплазма (mycoplasma);
• P – папоротникообразные растения (pteridophyte);
• S – семенные растения (seedplans);
• V – позвоночные (vertebrate)^[[2][1].

Для обозначения типа переносчика применяют следующие символы:

• Ac – клещи (Acarina, Arachnida);
• Al – белокрылки (Aleyrodidae, Homoptera, Insecta);
• Ap – тли (Aphididae, Homoptera, Insecta);
• Au – цикадки(Cicadellidae,Insecta);
• Cc – червецы (кокциды) (Coccodea, Homoptera, Insecta);
• Cl – жуки (Coleoptera, Insecta);
• Di – мухи, комары (Diptera,Insecta);
• Fu – грибы (Fungu);
• Gy – клопы (Gymnocerata, Hemiptera)
• Ne – нематоды (Nematodes)
• Ps – псиллиды (листоблошки) (Psyllidae, Homoptera)
• Si – блохи (Siphonaptera, Insecta);
• Th– трипсы (Thysanoptera, Insecta);
• Ve– переносчик известен, но не принадлежит ни к одному из указанных выше типов;
• O – вирус распространяется без переносчика, то есть заражение осуществляется вирусом, находящимся в окружающей среде^{[2] [1]}.

Таким образом, по отношению к вирусу табачной мозаики, четвертая пара символов

(S/O) расшифровывается следующим образом: заражаемые организмы-хозяева – семенные растения, вирус распространяется без переносчика. Четвертая пара символов криптограммы ВТМ может выглядеть – S/*. В этом случае хозяин – тот же, но переносчик неизвестен^[1].